Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms