Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms