Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms