Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMF1P82094 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMF1P82094 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMF1P82094 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMF1P82094 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMF1P82094 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms