Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms