Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms