Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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FAM3BP58499 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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FAM3BP58499 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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FAM3BP58499 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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FAM3BP58499 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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FAM3BP58499 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FAM3BP58499 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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