Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NME5P56597 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NME5P56597 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME5P56597 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms