Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms