Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC3P51654 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC3P51654 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms