Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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RAB5CP51148 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RAB5CP51148 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RAB5CP51148 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RAB5CP51148 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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