Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTPAP49638 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTPAP49638 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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