Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCLMP48507 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCLMP48507 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCLMP48507 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCLMP48507 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCLMP48507 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCLMP48507 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCLMP48507 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms