Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIA4P48058 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms