Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms