Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms