Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms