Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms