Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms