Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms