Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PTX3P26022 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTX3P26022 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms