Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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