Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms