Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms