Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms