Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms