Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms