Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms