Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms