Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms