Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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