Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 TAF1D-201ENST00000323981 2540 ntTSL 214.64□□□□□ -0.071e-9■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 TAF1D-220ENST00000534770 737 ntTSL 314.62□□□□□ -0.071e-9■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 TAF1D-211ENST00000529508 538 ntTSL 213.81□□□□□ -0.21e-9■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 TAF1D-208ENST00000527690 335 ntTSL 32.86□□□□□ -1.951e-9■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.111e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.482e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-10■□□□□ 11.2
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PRPF4O43172 LUC7L3-212ENST00000508045 1112 ntTSL 1 (best)14.06□□□□□ -0.162e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 LUC7L3-206ENST00000504563 840 ntTSL 513.59□□□□□ -0.232e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 LUC7L3-214ENST00000508482 1597 ntTSL 212.77□□□□□ -0.372e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 LUC7L3-213ENST00000508218 533 ntTSL 212.56□□□□□ -0.42e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.42e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 LUC7L3-207ENST00000505619 658 ntTSL 312.3□□□□□ -0.442e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 LUC7L3-209ENST00000506686 582 ntTSL 411.99□□□□□ -0.492e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 LUC7L3-215ENST00000509335 582 ntTSL 211.99□□□□□ -0.492e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.732e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 CACNA2D4-214ENST00000541616 576 ntTSL 416.37■□□□□ 0.211e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 CACNA2D4-217ENST00000545595 1615 ntTSL 1 (best)15.97■□□□□ 0.151e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 CACNA2D4-205ENST00000536846 895 ntTSL 514.31□□□□□ -0.121e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 CACNA2D4-201ENST00000280663 5936 ntTSL 214.09□□□□□ -0.151e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 CACNA2D4-225ENST00000589502 680 ntTSL 313.64□□□□□ -0.231e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 CACNA2D4-206ENST00000537784 2876 ntTSL 1 (best)12.76□□□□□ -0.371e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.371e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 CACNA2D4-207ENST00000537923 556 ntTSL 412.36□□□□□ -0.431e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 CACNA2D4-202ENST00000382722 5475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.51e-7■□□□□ 11.2
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PRPF4O43172 CACNA2D4-222ENST00000587995 3883 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.791e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 CACNA2D4-203ENST00000444595 4450 ntTSL 1 (best)10□□□□□ -0.811e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 CACNA2D4-221ENST00000586184 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.831e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 CACNA2D4-223ENST00000588077 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.831e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.82e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.732e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-205ENST00000431834 1612 ntTSL 529.74■■■□□ 2.352e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.592e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.532e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-209ENST00000457960 881 ntTSL 522.12■■□□□ 1.132e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.752e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.72e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-208ENST00000455389 1431 ntTSL 319.44■□□□□ 0.72e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-212ENST00000477331 1041 ntTSL 218.94■□□□□ 0.622e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-211ENST00000475850 1965 ntTSL 218.69■□□□□ 0.582e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.352e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-206ENST00000432186 905 ntTSL 216.86■□□□□ 0.292e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.22e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-207ENST00000432916 1430 ntTSL 215.76■□□□□ 0.112e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-215ENST00000495017 2125 ntTSL 1 (best)15.54■□□□□ 0.082e-10■□□□□ 11.2
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PRPF4O43172 PRR5-ARHGAP8-203ENST00000495250 1271 ntTSL 213.96□□□□□ -0.172e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-ARHGAP8-204ENST00000515632 1590 ntTSL 213.72□□□□□ -0.212e-10■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PRR5-214ENST00000492475 920 ntTSL 513.72□□□□□ -0.212e-10■□□□□ 11.2
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PRPF4O43172 ZNF83-208ENST00000596440 561 ntTSL 47.07□□□□□ -1.282e-10■□□□□ 11.2
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PRPF4O43172 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.455e-13■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 WDR82-204ENST00000487402 4333 ntTSL 210.67□□□□□ -0.75e-13■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 TRIO-206ENST00000504606 817 ntTSL 211.16□□□□□ -0.622e-11■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 TNFRSF12A-207ENST00000575836 161 ntTSL 314.69□□□□□ -0.069e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.521e-6■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.591e-6■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.167e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.237e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.257e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 PPP4R3B-204ENST00000612688 2981 ntTSL 212.11□□□□□ -0.477e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 MXD4-202ENST00000510822 561 ntTSL 315.97■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 MXD4-205ENST00000515378 522 ntTSL 213.83□□□□□ -0.22e-6■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.37e-31■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 ARF3-205ENST00000536283 537 ntTSL 421.12■□□□□ 0.973e-8■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 ARF3-206ENST00000539611 576 ntTSL 520.26■□□□□ 0.833e-8■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.753e-8■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.583e-8■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 ARF3-204ENST00000485410 563 ntTSL 318.36■□□□□ 0.533e-8■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.323e-8■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.312e-7■□□□□ 11.1
PRPF4O43172 AMPD2-216ENST00000527846 585 ntTSL 416.57■□□□□ 0.242e-7■□□□□ 11.1
PRPF4O43172 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.62□□□□□ -0.072e-7■□□□□ 11.1
PRPF4O43172 MVD-207ENST00000563463 543 ntTSL 315.07■□□□□ 06e-15■□□□□ 11.1
PRPF4O43172 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■□□□□ 11.1
PRPF4O43172 EIF4G1-221ENST00000441154 4311 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.692e-6■□□□□ 11.1
PRPF4O43172 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.681e-8■□□□□ 11.1
PRPF4O43172 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.181e-8■□□□□ 11.1
PRPF4O43172 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.721e-8■□□□□ 11.1
PRPF4O43172 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.568e-7■□□□□ 11.1
PRPF4O43172 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.538e-7■□□□□ 11.1
PRPF4O43172 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.521e-8■□□□□ 11.1
PRPF4O43172 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 11.1
PRPF4O43172 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.331e-8■□□□□ 11.1
PRPF4O43172 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.322e-6■□□□□ 11.1
PRPF4O43172 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-6■□□□□ 11.1
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