Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms