Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TO15178 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TO15178 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms