Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERINC4A6NH21 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERINC4A6NH21 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms