Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms