Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms