Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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