Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms