Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RAD54L2Q9Y4B4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54L2Q9Y4B4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms