Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMC9Q9Y3B6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms