Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG6Q9Y2V7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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