Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RCE1Q9Y256 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RCE1Q9Y256 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RCE1Q9Y256 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RCE1Q9Y256 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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