Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms