Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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