Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms