Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms