Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXTL2Q9UBQ6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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EXTL2Q9UBQ6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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EXTL2Q9UBQ6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXTL2Q9UBQ6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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