Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IGSF9Q9P2J2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms