Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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